日益复杂的病毒疫情当前，怎样迅速、精确溯源及鉴定病原体成了防控的关键所在，一个将数据、工具以及可视化分析整合起来的一站式平台，正在给科研人员与公共卫生工作者提供强有力的技术支撑。
首页与数据入口
有一个首页设计，它属于平台，其特点是简洁明了，能给用户提供清晰的数据以及工具导航。在这里，用户能够快速进入不同的功能模块，不管是浏览数据，还是进行分析，操作路径都特别直观。
首页不唯有一个入口，更乃整个资源库的概览中心，其展现了平台的核心价值，此价值为将分散的病毒序列数据、分析工具以及知识体系整合于一个统一的界面里，如此一来，极大地提升了研究工作的启动效率。
序列数据全景浏览
在序列数据概览的页面之中，用户能够针对平台所收录的全部基孔肯雅病毒序列展开全局审视。此页面借助表格以及统计图表的形式，把序列的总数、长度分布、数据来源等基础信息予以集中展示。
针对此页面，研究者能够开展初步的数据筛选以及探索工作。比如说，依据国家、宿主、采样年份等诸多条件来过滤序列，从而能够迅速定位到自身感兴趣的数据子集，进而为后续的深入分析筑牢坚实的基础。
宿主与物种信息总览
以展示病毒宿主信息为专注点的物种概览页，清晰地把曾从诸如人类、伊蚊、蝙蝠等动物身上分离出来的病毒列了出来，还给出了对应各种宿主的序列数量统计。
这一视图对理解病毒的生态学以及传播周期而言是至关重要的，经由分析不同宿主的感染情形，研究人员能够评估各类动物于病毒维持以及传播当中兴许扮演的角色，进而识别出关键的传播环节。
知识图谱关联洞察
将知识图谱页面呈现为网络图样式，以此揭示病毒、基因、宿主、地理位置等许许多多种类实体相互之间复杂的关系，这样一种可视化的方式，能够助力用户直观地去发现，潜藏在大数据背后的种种模式以及彼此间的联系。
比如说，图谱能够呈现出某一种特定的基因型跟某个地理区域之间存在的强关联，又或者是某种宿主和特定基因突变一同出现的频率。这种关联分析能够给病毒进化研究以及传播风险评估提供全新的线索。
溯源与进化分析实战
适配溯源分析系统的平台的一站式分析平台，用户上传至少3条FASTA格式的序列以及相关元数据，像采样时间和地点，系统就能够自动完成多序列比对，进而构建系统发育树。
这个系统运用MAFFT来开展高精度的比对工作，并且采用IQ-TREE 2依据最大似然法去构建进化树。其结果是以交互式树状图的形式予以展示的，并结合地图，使得研究者能够清晰地去追溯毒株之间的进化关系以及可能的传播路径。
变异鉴定与分型工具
该平台除了具备溯源功能外，还提供了用于识别细微遗传变异的SNP分析工具，以及能够快速鉴定病毒基因型的工具。就其中的SNP分析而言，它是借助比对多条序列的方式，从而精确识别单核苷酸变异位点的，这种方式对于区分高度相似的毒株极为有效。
内置覆盖6个主要基因型的数百条参考序列的是基因型鉴定工具，用户上传待测序列后，系统能迅速给出其基因型分类结果，还能展示该基因型在全球的分布情况，极大加快了病原体的识别速度。
你觉得，这个将数据、分析以及可视化整合于一身的平台，在往后应对新出现的传染病之际，其最大的应用潜力会体现在哪一个环节呢？欢迎于评论区把你的看法分享出来，要是认为本文具备帮助作用，请进行点赞给予支持。
